近年來，我國發酵類制藥產業發展快速，產生了大量的廢水。發酵類藥物產品主要有抗生素、氨基酸、維生素和其他幾大類型。發酵類藥品的生產過程一般都需要經過菌種的篩選、種子制備、微生物發酵、發酵液預處理和固液分離、提煉純化、精制、干燥、包裝等步驟，生產過程中將會有產生大量的高濃度的有機廢水，由此對環境造成嚴重的污染。

　　1、好氧移動床生物膜法

　　MBBR是通過向反應器中投加一定數量的懸浮載體，提高反應器中的生物量及生物種類，從而提高反應器的處理效率的一種污水處理方法。另外，每個載體內外均具有不同的生物種類，內部生長一些厭氧菌或兼氧菌，外部為好養菌，這樣每個載體都為一個微型反應器，使硝化反應和反硝化反應同時存在，從而提高了處理效果。

　　2、特異性流化生物膜法

　　SMBBR與傳統的MBBR的運行方式相似為：在氧氣充足的條件下，微生物在填料的表面聚附著形成生物膜，當廢水以一定的流速流過填料時，生物膜中的微生物能夠吸收分解水中的有機物，從而使污水得到凈化，同時微生物得到增殖，生物膜也逐漸增厚。

　　可以看出發酵類制藥廢水在生產過程中排水點很多，高、低濃度廢水的單獨排放，有利于清污分流，高濃度廢水間歇排放，酸堿度和溫度變化比較大，污染物濃度高，如廢濾液、廢母液等的COD一般在10000mg/L以上。